生殖器疱疹是由單純疱疹病毒（Herpes Simplex Virus, HSV）所造成的感染性疾病，會產生疼痛性水疱。疱疹病毒有兩型，第一型（HSV-1）的原發感染（就是第一次初感染）多發生在五歲以下的小孩，多長在口腔嘴角附近；痊癒後病毒會潛藏在口鼻黏膜細胞內，在免疫力下降時（如感冒、勞累）復發，俗稱「火氣大」。

第二型疱疹病毒（HSV-2）則常引起生殖器疱疹，多初發生於成人，經性行為傳染，水泡可長在生殖器、陰囊、陰唇、子宮頸、會陰部，甚至肛門周圍。

單純疱疹是個流行廣泛的疾病，成人約70至90%得過HSV-1。，但僅20%得過HSV-2。單純疱疹的傳染途徑是直接接觸水疱液體造成（其內有病毒）；原發型的潛伏期都約一星期，多是數個小水疱群聚在一起，約七至十天可自癒。但感染性卻可持續到兩週（也就是水疱乾後仍有感染性），所以即使水疱結痂，仍要小心。復發型疱疹則症狀較輕，水疱較不明顯，有時甚至不出水疱，也比較不痛，倒是搔癢較劇，但其滲液卻有傳染性（傳染期較短，約四至七天），這就是預防的難處。

另外，孕婦在生產時若感染第二型疱疹，則會傳染給新生兒，造成全身性的感染，腦炎、甚至死亡，所以應改為剖腹生產較安全。HSV-2同時也是女性子宮頸癌的危險因子，所以不得不防。現在因性行為花樣繁多，口交肛交已不稀奇，單從泡疹的部位已難確認是第一型或第二型。

疱疹的診斷靠水疱的部位和特徵；抽血測抗體只是輔助，因為太多人得過，幫助不大。截至目前為止，病毒感染幾乎無藥可治（都是自癒的，包括腸病毒、登革熱，醫生只是幫身體渡過難關），單純疱疹自不例外，治療的原則是止痛和預防水疱破皮後的傷口感染，所以患部應保持清潔及塗抹抗生素軟膏。抗病毒藥Acyclovir對原發型疱疹可以減輕疼痛及加速痊癒，但效果有限，對復發型則效果更差。

容易令人混淆的是水痘（Chickenpox）和帶狀疱疹（Herpes Zoster），這兩種病是由同一種病毒Varicella-zoster Virus造成，原發於小孩，水疱是分散狀（不是群聚狀），從軀幹先長，迅速擴散到四肢及臉部；痊癒後，病毒會躲在神經節裡，當免疫力低時再復發。復發時病毒從神經節竄出，所以水疱會侷限在整條神經所支配的皮膚，故形成「帶狀疱疹」，台語俗稱「皮蛇」。這個病毒藉飛沫傳染，不是接觸傳染，當然也不是性病。小孩子若未「出過水痘」，有疫苗可注射（不過卻需自費，健保並不給付）。